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基于启动子工程改造脂肽surfactin合成途径任务书

 2020-06-06 09:51:53  

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1、毕业论文内容
生物表面活性剂(surfactin)是由一条β-羟基脂肪酸和具有不同手性的七氨基酸缩肽通过内酯键连接而成。

它是芽孢杆菌产生的一种次级代谢产物,具有可降解,低毒的特点,在医药、食品、生物修复、生物防治等方面具有很大的潜在应用价值。


Surfactin的一大特点就是起泡性,而且芽孢杆菌是好氧细菌,在发酵过程中需要通大量氧气,因而在前期产生surfactin,就会导致菌体与发酵液的流失。

国内外学者针对泡沫,设计了不同消泡装置,增加了建设费用,效果又不是很好,所以亟需一种可以从源头上减少泡沫又不能减少氧气的供应的方式。


细菌生产surfactin是由非核糖体肽合成酶( NRPS)、sfp蛋白、脂肪酸合成三大模块相互作用组成,目前国内外已有报道通过提高NRPS的合成量从而提高它的产量,但目前没有人通过控制sfp蛋白表达来提高surfactin的产量。


启动子是由基因到蛋白的一个重要元件,它决定着DNA转录到mRNA的数量,因而启动子的强弱就可以控制蛋白产量。

一般surfactin生产菌的sfp蛋白基因启动子是组成型的,可将surfactin合成中必需的Sfp功能蛋白改造成溶氧诱导启动子(vgb promoter)调控,在低溶氧条件下诱导surfactin的合成,减少在发酵过程中消耗的动能,减少泡沫的产生,又不增加泡沫的产生,为产业化提供可能。


2、毕业论文要求
1)温习各种查阅文献的方法,在此基础上阅读大量与课题相关资料(尤其是外文文献),及时了解国内外surfactin的研究情况;并学习关于分子生物学的相关操作,设计实验步骤。


2)遵守实验章程,规范实验操作,端正实验态度,并熟练使用各种常规实验仪器。


3) 能够分析和解决实验中出现的各种实验现象,基本具备独立实验能力。


4)及时记录并整理实验数据,学会如何分析处理实验数据及结果,保证实验数据真实性和可靠性。


2. 参考文献

[1]Zhai, S., Q. Shi, and X. Chen, Effect of dietary antimicrobial peptides-surfactin supplementation on parameters of intestinal health indices of genetically improved farmed tilapia (gift, oreochromis niloticus)[J]. Acta Hydrobiologica Sinica, 2016. 40(4): p. 823-829.
[2]Zhang, Y., et al., Anti-inflammatory Activity and Mechanism of Surfactin in Lipopolysaccharide-Activated Macrophages[J]. Inflammation, 2015. 38(2): p. 756-764.
[3]de Almeida Couto, C.R., et al., Response of the bacterial community in oil-contaminated marine water to the addition of chemical and biological dispersants. Journal Of Environmental Management[J], 2016. 184: p. 473-479.
[4]Jasim, B., J. Mathew, and E.K. Radhakrishnan, Identification of a novel endophytic Bacillus sp from Capsicum annuum with highly efficient and broad spectrum plant probiotic effect[J]. Journal Of Applied Microbiology, 2016. 121(4): p. 1079-1094.
[5]翟少伟, 李剑,史庆超, 抗菌脂肽Surfactin的抗菌活性及应用[J]. 动物营养学报, 2015(05): p. 1333-1340.
[6]任鹏举, 枯草芽孢杆菌OKB105产生的surfactin防治烟草花叶病毒病及其机理研究[J]. 中国生物防治学报, 2014(02): p. 216-221.
[7]Yeh, M.S., Y.H. Wei, and J.S. Chang, Bioreactor design for enhanced carrier-assisted surfactin production with Bacillus subtilis[J]. Process Biochemistry, 2006. 41(8): p. 1799-1805.
[8]Chtioui, O., et al., Biosurfactants production by immobilized cells of Bacillus subtilis ATCC 21332 and their recovery by pertraction[J]. Process Biochemistry, 2010. 45(11): p. 1795-1799.
[9]Guez, J.S., et al., Setting up and modelling of overflowing fed-batch cultures of Bacillus subtilis for the production and continuous removal of lipopeptides[J]. Journal Of Biotechnology, 2007. 131(1): p. 67-75.
[10]刘丽霞, Surfactin合成酶相关基因研究[D]. 2012, 南京农业大学.
[11]Willenbacher, J., et al., Substitution of the native srfA promoter by constitutive P-veg in two B. subtilis strains and evaluation of the effect on Surfactin production[J]. Journal Of Biotechnology, 2016. 224: p. 14-17.
[12] Wei, X.-X. and G.-Q. Chen, Applications of the VHb gene vgb for improved microbial fermentation processes, in Globins And Other Nitric Oxide-Reactive Proteins[J], Pt A, R.K. Poole, Editor. 2008. p. 273-280.

3. 毕业设计(论文)进程安排

起讫日期

设计(论文)各阶段工作内容

备 注

12.1~12.31

文献查阅及资料研读

1.1~1.17

确定实验方案及开题报告写作

1.18~3.28

重组质粒与重组菌的构建

4.1~4.30

发酵工艺及产量测定

5.1~5.31

实验结果分析

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