基于区域感应卷积神经网络的细胞分割方法开题报告
2020-02-18 20:00:20
1. 研究目的与意义（文献综述）
1. 目的及意义（含国内外的研究现状分析）
1.1 目的及意义
图像分析在细胞生物学上有很好的应用，是在大图像集合上准确且自动化分析和量化相关生物学的关键，是各种医学图像应用的基础，其优势有时间空间上的精确性、快速性和灵敏性。从基于图像的分析到高内容筛选[1,2]，显微镜图像已经开启了遗传扰动的理解、药物研究的探索、表型细胞在生物医学应用和细胞生物学上的研究[3,4]。
2. 研究的基本内容与方案
2. 研究（设计）的基本内容、目标、拟采用的技术方案及措施
2.1 基本内容
1. 在数据集bbbc022和van valen上训练和测试语义分割模型u-net，观察分割错误（合并和拆分）的比例。其中数据集中50%的图像用于训练，25%用于验证，25%用于测试。
3. 研究计划与安排
3. 进度安排
| 时间节点 | 内容 |
| 2019年1月11日-2019年1月31日 | 阅读文献，主要是细胞分割和物体分割的相关的文献； |
| 2019年2月1日-2019年2月28日 | 掌握技能，具有针对性的学习编程语言，算法，图像处理相关知识，实现基于区域感应卷积神经网络的目标检测算法，完成开题报告 |
| 2019年3月1日-2019年3月31日 | 细胞分割数据标注及训练 |
| 2019年4月1日-2019年4月30日 | 通过训练好的模型在测试数据集上进行测试分析 |
| 2019年5月1日-2019年6月 | 撰写毕业论文及准备答辩 |
4. 参考文献（12篇以上）
4. 参考文献
1. boutros, m., heigwer, f. amp;laufer, c. microscopy-based high-content screening. cell 163, 1314–1325 (2015).
2. mattiazzi usaj, m. et al.high-content screening for quantitative cell biology. trends cell biol. 26,598–611 (2016/8).
