磷酸钙预成核束的形成及其分子自组装行为任务书
2020-06-26 19:53:13
1. 毕业设计(论文)的内容和要求
论文的内容:本课题通过计算形成磷酸钙预成核簇的自由能和模拟预成核簇的结合过程,探索磷酸钙成核前期的热力学行为变化。
要求是: 1、 理解分子模拟的基本概念、原理; 2、熟悉分子动力学模拟软件gromacs的基本知识,操作步骤,并学会使用; 3、了解最新研究进展; 4、掌握自由能模拟计算方法; 5、合理安排实验进程,工作时间不迟到、早退; 6、实验认真仔细,对实验现象进行详细的记录,定期对实验数据进行总结,及时调整实验方案; 7、 工作积极主动,勤于思考,做好实验室安全卫生工作。
2. 参考文献
(1) Betts, F.; Posner, A. An X-ray radial distribution study of amorphous calcium phosphate. Mater. Res. Bull. 1974, 9, 353#8722;360. (2) Du, L.-W.; Bian, S.; Gou, B.-D.; Jiang, Y.; Huang, J.; Gao, Y.-X.; Zhao, Y.-D.; Wen, W.; Zhang, T.-L.; Wang, K. Structure of Clusters and Formation of Amorphous Calcium Phosphate and Hydroxyapatite: From the Perspective of Coordination Chemistry. Cryst. Growth Des. 2013, 13, 3103#8722;3109. (3) Habraken, W. J. E. M.; Tao, J.; Brylka, L. J.; Friedrich, H.; Bertinetti, L.; Schenk, A. S.; Verch, A.; Dmitrovic, V.; Bomans, P. H. H.; Frederik, P. M.; Laven, J.; van der Schoot, P.; Aichmayer, B.; de With, G.; DeYoreo, J. J.; Sommerdijk, N. a. J. M. Ion-association complexes unite classical and non-classical theories for the biomimetic nucleation of calcium phosphate. Nat. Commun. 2013, 4, 1507. (4) Vekilov, P. G. Nucleation. Cryst. Growth Des. 10, 5008#8211;5019 (2010). (5) Hu, Q. et al. The thermodynamics of calcite nucleation at organic interfaces: classical versus non-classical pathways. Faraday Discuss. 159, 509#8211;523 (2012). (6) Friddle, R. W. et al. Subnanometer atomic force microscopy of peptide#8211;mineral interactions links clustering and competition to acceleration and catastrophe.Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107, 11#8211;15 (2010). (7) Urch, H., Vallet-Regi, M., Ruiz, L., Gonzalez-Calbet, J. M. Epple, M. Calcium phosphate nanoparticles with adjustable dispersability and crystallinity.J. Mater. Chem. 19, 2166#8211;2171 (2009). (8) Shi, W.-Y.; Wang, F.-Y.; Xia, M.-Z.; Lei, W.; Zhang, S.-G.Acta Chim. Sinica 2006, 64(17), 1817 (in Chinese). (石文燕, 王风云, 夏明珠, 雷武, 张曙光, 化学学报, 2006, 64(17), 1817.) (9) Xia, M.-Z.; Lei, W.; Sun, Y.-P.; Wang, F.-Y. Chin. J. Appl. Chem. 2000, 17(4), 405 (in Chinese). (夏明珠, 雷武, 孙元鹏, 王风云, 应用化学, 2000, 17(4), 405.) (10) 席周周. 溶液中磷酸钙类晶体成核早期的分子动力学模拟[D]. 华南理工大学, 2015.
3. 毕业设计(论文)进程安排
起讫日期 设计(论文)各阶段工作内容 18.1.4~18.3.10 文献调研,开题报告 18.3.10~18.5.21 开展实验工作 18.5.21~18.5.28 中后期实验阶段及数据收集 18.5.21~18.6.10 数据整理,撰写论文,准备答辩