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高GC含量的目的基因在大肠杆菌中的检测开题报告

 2020-05-10 02:36:56  

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

人类首条人工合成的基因出现在上世纪60年代 基因合成是当前合成生物学的主要内容,通过基因合成,可以获得自然界中不存在的基因,为人类改造生物开辟了一个全新的方向,在可预计的将来,基因合成将在生命科学领域发挥巨大作用,在新能源、新材料、人工生命、核酸疫苗、生物医药等领域的作用已初步体现。同时我们也要对人工合成的基因进行检测。在检测基因时我们需要根据基因的gc含量来选择合适的检测方法和合适的检测条件。gc含量是指在dna4种碱基中,鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比率称为gc含量。在双链dna中,腺嘌呤与胸腺嘧啶(a/t)之比,以及鸟嘌呤与胞嘧啶(g/c)之比都是1。但是,(a t)/(g c)之比则随dna的种类不同而异。gc含量愈高,dna的密度也愈高,同时热及碱不易使之变性。高gc 含量一般指 gc含量高于60%。gc之间是三个氢键连接,而at之间是两个氢键连接。导致结果便是高gc含量的片段解链需要的能量高,tm值高。其次,退火时相对于正常引物而言,高gc含量引物更容易与互补序列配对,但是,与相近序列配对的可能性也比正常引物高,导致易出现非特异性条带,难以检测到目的基因。因此要采取合适和高效率的检测方法来检测高gc含量的目的基因。

目前,常用的基因检测方法有以下几种:

1、转录水平检测[1-3]:聚合酶链式反应(简称pcr)检测。pcr是体外酶促合成特异dna片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的dna得以迅速扩增, pcr由变性、退火、延伸三个基本反应步骤构成:1)模板dna的变性:模板dna经加热至93℃左右一定时间后,使模板dna双链或经pcr扩增形成的双链dna解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;2)模板dna与引物的退火(复性):模板dna经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板dna单链的互补序列配对结合;3)引物的延伸:dna模板与引物结合物在taqdna聚合酶的作用下,以dntp为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板dna链互补的半保留复制链重复循环变性、退火、延伸三过程,就可获得更多的”半保留复制链",而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍(plateau),使肉眼能直接观察和判断。在实验中就是运用专门仪器,使用dntps、mg2 、特异引物、dna聚合酶以及缓冲体系,加入模板也就是dna样品进行体外扩增,结果进行电泳,如果能扩增出,并且扩增的产物大小与目的条带一致,那说明引物与模板特异,检测指标就是阳性。有研究者从副溶血弧菌(vibrio parahaemolyticus)基因组dna中发掘得到了特异性很高的序列,并设计相应的特异性引物,人工构建扩增内标,建立pcr检测体系,检测到副溶血弧菌。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

2.1论文研究目的意义

以大肠杆菌为研究对象,结合抗性筛选和蓝白斑筛选、通过对pcr扩增反应条件的优化,探索高gc含量目的基因的检测方法。

2.2论文的主要研究内容

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