1. 本选题研究的目的及意义

石蒜属植物(lycoris)隶属于石蒜科，以其独特的生物学特性和观赏价值而闻名。

然而，由于其基因组信息相对匮乏，限制了对其遗传多样性、亲缘关系以及分子育种等方面的研究。

est-ssr标记作为一种基于转录组数据的分子标记，具有开发成本低、多态性高、跨物种通用性好等优点，为石蒜植物遗传研究提供了新的思路。

2. 本选题国内外研究状况综述

近年来，随着高通量测序技术的快速发展，est-ssr标记在植物遗传研究中得到了广泛应用。

国内外学者对水稻、小麦、玉米等重要农作物以及一些观赏植物的est-ssr信息分析和标记开发进行了深入研究，取得了丰硕成果。

例如，有研究利用est-ssr标记分析了水稻的遗传多样性和群体结构，揭示了水稻的起源和驯化过程。

3. 本选题研究的主要内容及写作提纲

1.收集和整理石蒜植物est数据，利用生物信息学工具对其进行ssr位点信息分析，包括ssr类型、频率、分布等，揭示石蒜植物est-ssr的特征。

2.基于筛选得到的ssr位点，设计并合成pcr引物，利用pcr技术对引物进行筛选和验证，开发出一套适用于石蒜植物遗传研究的est-ssr标记。

3.利用开发的est-ssr标记，对部分石蒜植物种质资源进行遗传多样性分析，为石蒜植物种质资源的鉴定、评价和利用提供科学依据。

4. 研究的方法与步骤

本研究将采用生物信息学和分子生物学相结合的方法。

首先，通过ncbi等公共数据库检索石蒜植物的est序列数据，利用misa等软件进行ssr位点识别和分析，统计ssr类型、频率、分布等信息，并利用primer3等软件设计est-ssr引物。

其次，利用pcr技术对设计的引物进行筛选和验证，筛选出扩增效率高、多态性好的est-ssr标记。

5. 研究的创新点

1.本研究首次对石蒜植物est资源进行系统全面的ssr信息分析，揭示石蒜植物est-ssr的特征，为石蒜植物分子标记开发和遗传研究提供基础数据。

2.本研究开发的est-ssr标记为新型功能标记，较传统的形态标记和细胞学标记具有更高的稳定性和多态性，可为石蒜植物种质资源鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种等提供更准确、可靠的技术手段。

3.本研究将est-ssr标记应用于石蒜植物遗传多样性分析，为揭示石蒜植物种质资源的遗传背景、亲缘关系以及进化历史提供新的视角，有助于更好地保护和利用石蒜植物种质资源。

6. 计划与进度安排

第一阶段 （2024.12~2024.1）确认选题，了解毕业论文的相关步骤。

第二阶段（2024.1~2024.2）查询阅读相关文献，列出提纲

第三阶段（2024.2~2024.3）查询资料，学习相关论文

7. 参考文献（20个中文5个英文）

[1] 张艳艳, 郭建军, 周永红, 等. 基于转录组测序的百合est-ssr信息分析及引物开发[j]. 园艺学报, 2018, 45(11): 2147-2158.

[2] 李梦莎, 王亮生, 张启翔, 等. 基于est-ssr标记的22份石蒜种质资源遗传多样性分析[j]. 西北植物学报, 2019, 39(1): 169-177.

[3] 刘洋, 王晓静, 王亮生, 等. 基于est-ssr标记的石蒜属部分种质资源遗传多样性分析[j]. 分子植物育种, 2020, 18(15): 5018-5025.