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毕业论文网 > 开题报告 > 化学化工与生命科学类 > 食品科学与工程 > 正文

应用DNA条形码技术鉴定南京市场上常见鲜、冻水产品的物种组成开题报告

 2020-06-03 22:07:23  

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

文献综述

1.1 我国鲜、冻水产品市场现状

1.1.1 我国水产品消费现状

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

2.1研究的内容

(1)市场采集的共54份鲜、冻水产品的DNA提取

(2)通用引物扩增COI条形码

(3)序列分析与物种鉴定

2.2主要的研究手段

(1)DNA的提取如下;

DNA的提取操作过程如下:取约200mg肌肉组织于2ml圆底离心管中,加入200micro;l 组织裂解液(500 mM Tris-HCl pH 8.0, 100 mM EDTA, 100 mM NaCl, 2% SDS)和200micro;l磷酸盐缓冲液(300 mM pH 8.0),用无菌手术剪刀将肌肉组织剪碎。再向该离心管中加入20micro;l蛋白酶K(20mg/ml),并将离心管置于65℃恒温水浴锅裂解60min。裂解结束后,14000g离心5min,吸取上清液并转入新的2ml圆底离心管。加入0.5倍体积的乙酸钠溶液(4M, pH 8.0),振荡混匀,14000g离心5min,吸取上清液并转入新的2ml圆底离心管。再加入0.5倍体积的乙酸钠溶液,振荡混匀,14000g离心5min,吸取上清液并转入新的1.5ml尖底离心管。加入0.6倍体积的异丙醇,振荡混匀,静置5min后14000g离心10min,弃去上清液。加入800micro;l 70% 乙醇,振荡混匀,14000g离心3min。弃去上清液,再加入800micro;l 100%乙醇,振荡混匀,14000g离心3min,弃去上清。75℃烘箱烘干后加入30micro;l 灭菌超纯水溶解DNA,并置于-20℃贮藏。DNA的浓度和纯度(A260nm/A230nm和A260nm/A280nm)用核酸蛋白测定仪测定,并稀释至100ng/micro;l备用。DNA的完整性通过1%琼脂糖凝胶电泳检测。

(2)COI条形码的扩增(表1);

表1 COI条形码通用引物序列

Primer name

Primer sequence (5′-3′)

Barcode length (bp)

FISHCOILBC_ts

CACGACGTTGTAAAACGACTCAACYAATCAYAAAGATATYGGCAC

705bp

FISHCOIHBC_ts

GGATAACAATTTCACACAGGACTTCYGGGTGRCCRAARAATCA

M13F (-21)

CACGACGTTGTAAAACGAC

NA

M13R (-27)

GGATAACAATTTCACACAGG

(3)采用Mega 5.0对序列进行分析

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