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基于SYBR-Green-I荧光定量PCR技术鉴定我国常见虾蟹品种方法的建立毕业论文

 2022-02-06 18:57:10  

论文总字数:15821字

摘 要

海产品原料和加工产品的掺假行为日益猖獗,这些掺假行为严重伤害了商家的利益,消费者的身体健康。针对这些掺假行为,需要科学、高效的方法来进行其物种的鉴定。本文以数种常见的虾蟹为研究对象,探讨了包括形态学分析、蛋白质分析、DNA分析在内的多种鉴定方法,由于形态学分析和蛋白质分析均存在不同程度的缺陷,有时无法准确鉴别物种,我们便选用DNA分析的方法来进行鉴别。我们从Genbank下载待测物种的COI基因序列,通过分析这些序列的种间/种内遗传距离,并与标准种间遗传距离进行对比,发现该方法能够有效地区分被选为目标样品的物种,在“10×规则”标准下,大多数物种依然能够被有效的鉴别,少数物种需要进一步的区分。因此,该方法能够成为虾蟹品种鉴定的有效方法和防止海产品掺假的有效手段。

关键词:虾;蟹;DNA;荧光定量PCR;COI基因序列;种间/种内遗传距离

ABSTRACT

The adulteration of seafood raw materials and processed products is increasingly rampant.These adulterations seriously harm the interests of businesses and the health of consumers.For these adulterations,scientific and efficient methods are needed to identify the species.In this paper,several common species of shrimp crabs were used as research objects,and various identification methods including morphological analysis, protein analysis,and DNA analysis were discussed.Since morphological analysis and protein analysis all have different degrees of defects,sometimes they cannot be accurately identified.For species,we use DNA analysis methods for identification.We downloaded the COI gene sequences of species to be tested from Genbank and analyzed the inter-species/intraspecific genetic distance of these sequences and compared them with the standard interspecific genetic distance.We found that this method can effectively distinguish the species selected as the target sample.Under the “10× rule” standard,most species can still be effectively identified,and a few species need further differentiation.Therefore,this method can be an effective method for identification of shrimp and crab species and an effective means to prevent adulteration of seafood.

Key words: Shrimp; crab; DNA; quantitative real-time PCR; COI gene sequence; interspecies/intraspecific genetic distance

目 录

摘 要 I

ABSTRACT II

第一章 文献综述 1

1.1虾蟹的生物学特性 1

1.1.1虾 1

1.1.2蟹 1

1.2几种常见的虾、蟹 2

1.2.1虾 2

1.2.2蟹 3

1.3我国虾蟹产业情况 4

1.4 虾蟹品种掺假 4

1.5常用虾蟹品种鉴定方法 5

1.5.1 基于形态学分析的方法 5

1.5.2 基于蛋白质分析的方法 5

1.5.3 基于DNA分析的方法 6

1.6 目的和意义 8

第二章 实验材料与方法 9

2.1序列下载 9

2.2 序列分析 9

第三章 实验结果与讨论 11

3.1 遗传距离分析 11

3.2 进化树分析 13

第四章 结论与展望 15

4.1 结论 15

4.2 展望 15

参考文献 17

致谢 19

第一章 文献综述

1.1虾蟹的生物学特性

1.1.1虾

虾是指一大类十足目的甲壳动物。广义来讲,任何具有拉长身体和以游泳为主要运动模式的群体都可称为虾。狭义上,虾是指对虾,包括带长长的狭窄肌肉尾巴(腹部),长须(天线)和细长腿的带茎的游泳甲壳类动物。任何类似虾的小型甲壳类动物往往被归为一类。他们通过划动腹部下方的泳衣向前游动,尽管他们的逃跑反应通常是反复挥动,尾巴很快将其向后推动。螃蟹和龙虾有强壮的步行腿,而虾具有薄而脆弱的腿,它们主要用于栖息[1]

虾广泛而丰富。有数千种适应各种栖息地的物种。在大多数海岸和河口以及河流和湖泊中,可以在底部发现他们。为了逃避捕食者,一些物种沉积物。他们通常存活一到七年。虾通常是孤独的,但它们可以在产卵季节形成大型的族群。

它们在食物链中发挥重要作用,并且是从鱼类到鲸鱼等大型动物的重要食物来源。许多虾的肌肉尾巴对人类是可食用的,并且它们被广泛捕获和养殖,供人食用。商业虾品种每年支持价值500亿美元的工业,2010年商业虾总产量接近700万吨。20世纪80年代,虾类养殖变得更加普遍,特别是在中国,到2007年,养虾场的收获量超过野生虾捕捞量。在野生环境捕虾时存在过量兼捕的重大问题,伴随着用于支持对虾养殖而对河口造成污染损害的问题。许多虾的体型很小,约2厘米(0.79英寸)长,但有些虾超过25厘米(9.8英寸)。较大的虾更有可能成为商业目标,通常被称为对虾[2]

1.1.2蟹

螃蟹是长有下肢的甲壳动物,螃蟹一般带有突出的“尾巴”,可能在胸部处消失不见。地球上大多数海洋、淡水、陆地都能看到他们的族群,螃蟹的身躯被厚实的外骨骼覆盖,长有两只爪。一些名称相似的动物如寄居蟹,帝王蟹,瓷蟹,马蹄蟹和蟹虱都不是真正的螃蟹[3]

螃蟹通常被厚厚的外骨骼覆盖,主要由高度矿化的几丁质组成。螃蟹的大小从几毫米宽的豌豆蟹到日本的蜘蛛蟹,腿高达4米(13英尺)[4]

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