一类beta蛋白拓扑结构的约化矩阵表示方法研究开题报告
2020-07-02 22:57:18
1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)
文 献 综 述 1.1β折叠二级结构研究 lifson和sander[1]首次研究了平行β折叠和反平行β折叠的氨基酸配对作用,指出相反电荷的氨基酸之间、具有支链的氨基酸(异亮氮酸、亮氨酸、缬氨酸)之间、以及侧链可以形成氢键的氨基酸之间容易产生相互作用。
然而,当时仅有30个已知结构的蛋白质样本,并且也只能按氨基酸的化学性质来给氨基酸分类。
1995年,wouters和curmi[2]利用253个已知结构的蛋白质样本分析了反平行β折叠结构中的氨基酸配对,结果表明相反电荷的氨基酸之间、含芳香环的氨基酸之间以及侧链可以形成氢键的氨基酸之间表现出明显的相互作用。
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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案
2.本课题要研究或解决的问题和拟采用的研究手段(途径): [研究目的] 分析、收集一类免疫球蛋白β三明治结构的突变的热力学与动力学数据,构建β蛋白变构的约化矩阵,开发并联突变的矩阵表示模型。
[研究内容] 1. 先通过蛋白质序列比对搜集合适的突变体蛋白pdb模型。
2. 然后接下来用现有的蛋白质模型去匹配标准模型,这样就可以得到计算简约矩阵的旋转矩阵。
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