荚蒾属药用植物DNA条形码鉴定研究开题报告
2020-04-13 15:54:52
1. 研究目的与意义(文献综述)
我国荚蒾属植物作为中药材使用的有43种,该属植物药用价值极高,荚蒾属植物是很重要的中草药,很多临床应用始载于唐《新修本草》。其根、茎、叶以及成熟的果实均可入药,具有清热解毒、祛风除湿、健脾消食、驱虫、强身、抗衰老等作用。功效主治:通经活络、活血消肿、祛风杀虫川。文献记载:《吉林中草药》中言其“通经活络、止血、镇痛、止咳。治腰酸腿痛、跌打损伤。”《东北常用中草药手册》言其“甘、苦、平。消肿、止痛、杀虫。”在小儿食疗与保健、小儿发育不良、老年病防治、妇科疾病、镇咳祛痰等方面都有较好的治疗作用。但由于荚蒾属植物分类复杂,不同种类植物特征性状不明显,所以给荚蒾属植物的鉴定带来很大的困难。
本文应用dna条形码技术对荚蒾属植物进行鉴定研究,简便、准确地鉴定荚蒾属植物,保障药材使用的安全性和有效性。
1、定义
dna条形码(dna barcode)是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的dna片段。
2、特点
理想的dna barcoding应当符合下列标准:
(1)具有足够的变异性以区分不同的物种,同时具有相对的保守性;
(2)必须是一段标准的dna区来尽可能鉴别不同的分类群;
(3)目标dna区应当包含足够的系统进化信息以定位物种在分类系统(科、属等)中的位置;
(4)应该是高度保守的引物设计区以便于通用引物的设计;
(5)目标dna区应该足够的短以便于有部分降解的dna的扩增… 。
dna barcoding作为生物“种水平species—level”鉴定的工具引人注目。genbank数据库中co i序列正在快速增加。min等分析了co i序列及其来源基因组核苷酸含量之间的关系,结果表明849个co i基因的5 端的dna barcoding序列令人惊奇地准确地代表了其来源完整线粒体基因mtdna的重要信息,也就是说对于未测序的基因组,从dna barcoding能快速预知完整基因组的组成。
3、 优点
(1)以dna序列为检测对象,其在个体发育过程中不会改变。同种生物不同生长时期的dna序列信息是相同的。同种生物不同生长时期的dna序列信息是相同的,即经过加工,形态发生变化,而dna序列信息不会改变,较之传统的方法,扩大了检测样本范围;同时样本部分受损也不会影响识别结果。
(2)可进行非专家物种鉴定。该技术是机械重复的,只要设计一套简单的实验方案,经过简单培训的技术员即可操作。
(3)准确性高。特定的物种具有特定的dna序列信息,而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致物种的鉴定误差。
(4)通过建立dna条形码数据库,可以一次性快速鉴定大量样本。分类学家新的研究成果将不断地加入数据库,成为永久性资料,从而推动分类学更加快速深入地发展。
4、意义
2. 研究的基本内容与方案
2.1 研究的基本内容
1、在文献系统调研的基础上,明确研究内容,了解研究所需的实验仪器和药品试剂,对文献报道利用植物dna条形码技术对荚蒾属药用植物的鉴定进行归纳、总结,提出采用的方法和研究方案。
2、采集药材及原植物样品,提取dna ,获得dna条形码序列,并对序列进行评价。
3、dna条形码候选序列的 barcoding gap 检验及构建dna条形码鉴定体系。
2.2研究的目标
本文应用dna条形码技术对荚蒾属植物进行鉴定研究,简便、准确地鉴定荚蒾属植物,保障药材使用的安全性和有效性。
2.3研究拟采用的技术方案及措施
3. 研究计划与安排
第1-2周:查阅相关文献资料,明确研究内容,了解所需的实验仪器和药品试剂。确定方案,完成开题报告。
第3-12周:根据方案,开展实验项目。
第13-14周:完成并修改毕业论文。
4. 参考文献(12篇以上)
[1] chen s, xu j, liu c, et al. genome sequence of the model medicinal mushroom ganoderma lucidum[j]. nature communications, 2012, 3(2):913.
[2] pang x, liu c, shi l, et al. utility of thetrnh–psbaintergenic spacer region and its combinations as plant dna barcodes: a meta-analysis[j]. plos one, 2012, 7(11):e48833.
[3] laiou a, mandolini l a, piredda r, et al. dna barcoding as a complementary tool for conservation and valorisation of forest resources[j]. zookeys, 2013, 365(365):197-213.