1. 研究目的与意义（文献综述）

选题目的及意义：识别蛋白质复合物是一项理解细胞中蛋白质作用机制的必要任务。很多计算方法因此被应用于识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的蛋白质复合物。除了可以被计算方法采用用于识别蛋白质复合物的信息外，还有ppi网络中的图拓扑结构，把蛋白质的功能信息考虑在内现在变得很流行。相关的方法实现依赖于这样的思想：同一个蛋白质复合物中的蛋白质和相似的功能信息有关系。然而，我们在以前的研究中发现对于大多数蛋白质复合物来说他们的蛋白质只是在一些功能种类的子集类似而不是所有功能，因此如果识别蛋白质复合物的时候把每个功能种类的参数考虑在内，结果准确性将会提升。

国内外研究现状：

2. 研究的基本内容与方案

研究目标：

基于已发表的蛋白质复合物识别方法来设计和实现在线蛋白质复合物识别系统，并通过互联网向科研人员开放。

3. 研究计划与安排

2018.1.14-2018.3.5：查阅文献、撰写开题报告

2018.3.6-2018.4.30：系统架构、程序设计与开发、系统测试与完善

2018.5.1-2018.5.25：撰写及修改毕业论文

4. 参考文献（12篇以上）

1. hulun,and keith cc chan.”a density-based clustering approach for identifying overlappingprotein complexes with functional preferences.”bmc bioinformatics16,no.1(2015):174.

2. spirin, victor, and leonid a. mirny. "protein complexes andfunctional modules in molecular networks." proceedings of thenational academy of sciences 100, no. 21 (2003): 12123-12128.

3. 鱼亮, 高琳, 孙鹏岗."蛋白质网络中复合体和功能模块预测算法研究." 计算机学报 34, no. 7 (2011): 1239-1251.

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