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基于高通量数据识别结肠癌的生物标记物的研究开题报告

 2020-02-10 23:09:02  

1. 研究目的与意义(文献综述)

①研究的目的

恶性肿瘤是现如今严重危害人类健康的疾病之一,最常见的有大肠癌、乳腺癌、肝癌、肺癌等。结肠癌是人类和动物高发性恶性肿瘤,发病率和致死率每年都在累计上升。结肠癌是全球癌症死亡的第二大原因,尽管近年的研究已取得重大进展,但其疗效仍依赖于结肠癌是否能被早期诊断,故寻找其特异性生物标记物对肿瘤的早期诊断和治疗是非常有意义的。

结肠癌的早期发现、早期诊断、早期治疗尤为重要,结肠癌的早期诊断方法一般有超声、放射学、同位素、细胞学检查和血清肿瘤标记物等。近年来结肠癌的治疗疗效不断增强,治疗手段有传统的手术、放疗、化疗和新兴的肿瘤生物疗法。结肠癌的发生发展、转移、复发和预后等并不是因单个因素决定的、而是由多种因素多种基因调控的。

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2. 研究的基本内容与方案

(1)研究(设计)的基本内容

本文主要是利用多元统计方法和机器学习算法对结肠癌数据进行特征选择、分类、预后等工作达到识别有效生物标记物的目的,然后,根据结论对结肠癌早期诊断以及预后的临床应用提出相关建议。

(2)研究(设计)的目标

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3. 研究计划与安排

第1-3周:查阅有关生物标记物方面的文献资料,明确研究的主要内容,了解研究所需理论知识和方法,温习所学过多元统计分析方法,了解并学习机器学习相关算法。

第4-5周:翻译相关的英文文献,确定研究方案,撰写毕业论文开题报告。收集数据,利用软件对数据进行统计建模分析。按时完成毕业设计(论文)周记,按照指导老师的意见认真改正自己的不足之处。另外,还要完成任务书的撰写工作。

第6-8周:收集结肠癌基因数据,对数据进行预处理。完成特征筛选工作,利用筛选得到的特征基因建立模型进行分类工作,计算分类的准确率。通过调整相关参数,观察分类准确率的变化。完成毕业设计(论文)中期进展情况检查表。

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4. 参考文献(12篇以上)

[1] [1] b. shen (ed.), bioinformatics for diagnosis, prognosis andtreatment of complex diseases,translational bioinformatics 2013.17-31.

[2] [2]李颖新,李建更,阮晓钢.肿瘤基因表达谱分类特征基因选取问题及分析方法研究[j].计算机学报,2006, 29(2):324-330.

[3] [3]刘圣辉. 基于基因表达数据的新型特征提取算法研究[d]. 2018.

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