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分子遗传数据可视化工具的开发开题报告

 2021-08-08 03:18:56  

全文总字数:441字

1. 研究目的与意义

一、研究目的:

1、遗传数据的显示

2、遗传数据的导入导出

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2. 国内外研究现状分析

broad研究院的研究人员开发了一种新颖且免费的可视化工具integrative genomics viewer(igv),能帮助使用者同时整合并分析不同类型的基因组数据,并能灵活放大基因组上的某个特定区域。

virs(一款基于dna序列的限制性酶切位点识别的可视化工具)是为了实现限制性内切酶剪切位点的预测和可视化而设计的在线平台。它能对多个dna序列同时进行分析,产生可视化的图谱,伴随在图谱的下面有一些按钮可供用户的自定义选择。这些选择能对限制性图谱更深入地分析,例如提供剪切片段的虚拟电泳图结果等。virs不同于其它同类的分析软件,它不仅有可视化的输出,而且又提供了商业酶的详细信息。并且这些信息是储存在我们的内部数据库中,数据每月会定时自动更新。平台免费开放使用。

现代的数据可视化(data visualization)技术指的是运用计算机图形学和图像处理技术,将数据换为图形或图像在屏幕上显示出来,并进行交互处理的理论、方法和技术。它涉及到计算机图形学、图像处理、计算机辅助设计、计算机视觉及人机交互技术等多个领域。数据可视化概念首先来自科学计算可视化(visualization in scientific computing),科学家们不仅需要通过图形图像来分析由计算机算出的数据,而且需要了解在计算过程中数据的变化。随着计算机技术的发展,数据可视化概念已大大扩展,它不仅包括科学计算数据的可视化,而且包括工程数据和测量数据的可视化。学术界常把这种空间数据的可视化称为体视化(volum visualization)技术。近年来,随着网络技术和电子商务的发展,提出了信息可视化(information visualization)的要求。我们可以通过数据可视化技术,发现大量金融、通信和商业数据中隐含的规律,从而为决策提供依据。这已成为数据可视化技术中新的热点。

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3. 研究的基本内容与计划

一、研究内容:

本工具主要使用html5编程,运用字符串解析功能实现将遗传数据代码转化为图像,制作成网页模式,方便遗传数据的直观可视化,并实现添加、提取、比较等功能,笔触上实现区域放大效果,提供读取文件的功能

二、功能介绍

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4. 研究创新点

分子遗传数据的繁琐和数目众多为研究工作中的比较和提取制造了很大的麻烦,进行大数据且有规律的数据比较,对于可视化工具的开发需要是非常迫切的,在遗传数据的领域中目前也没有直观实现其效果的工具,另一方面,HTML5是最近新兴的一门技术,对于在实现网页布局和动态效果有着良好的帮助,使用该技术的程序在目前为数不多,熟练掌握HTML5编程对于未来程序网页发展技术有着良好的预备作用。

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