基因表达谱数据分析开题报告
2022-01-28 21:40:40
1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1.本课题研究目的及意义基因在遗传学上有重要作用,基因决定了物种形态。
基因表达谱能够描绘特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰富信息,其最终目的是通过从基因实验获取的基因表达谱数据来探讨在某一特定生物学状态下的预测基因调控功能。
2.本课题在国内外研究状态及应用前景现如今,基因芯片技术已经有了巨大的影响,一个芯片能够同时测出上千万及基因的表达情况。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究的目标对基因表达谱数据进行分析,在gauusia混合模型下,使用正交多项式,以数量性状表型值和基因表达之间的非线性关系为基础,创造一个特殊的算法使基因群聚。
运用模型,与表型值有关的基因表达模式下聚类,em算法计算模型参数值。
2.研究内容1)对已有的基因表达分析方法进行分析对比。
3. 研究的方法与方案
1.研究方法:采用聚类分析研究方法2.技术路线与实验方案:熟悉有关sas程序,结合图形分析基因表达与mmse的非线性关系,用em算法算出参数估计值以及算出集群的最佳数目。
最后总结出可行方案的可行性,并尽可能推广运用到现实生产实用中。
3.可行性分析:1)基因芯片的发展,让基因分析更具可行性。
4. 研究创新点
ad基因芯片实验是一个基因表达和mmse之间非线性关系的具体实例。
已经存在的研究线性关系的方法不能用于这些案例的表型值与基因表达的关系。
于是,我们研究一种能够用于数量性状表型值与基因表达非线性关系的特殊的算法,并在gauusia混合模型下使用正交多项式。
5. 研究计划与进展
2015.02.01至2015.03.01收集资料,学习有关书籍文献,完成开题报告2015.03.02至2015.04.01对比分析几种聚类方法,拟定方案。
2015.04.02至2015.04.14完成设计初稿及中期报告2015.04.14至2015.05.06根据实验结果设计出可行性方案,并完成毕业论文。
2015.05.07至2015.05.15自审、互审,完成修改工作,准备答辩。